Gènes, Vol. 15, pages 166 : Découvrir les adaptations évolutives chez les phacochères communs grâce à des analyses génomiques
Gènes doi : 10.3390/genes15020166
Auteurs : Xintong Yang Xingzheng Li Qi Bao Zhen Wang Sang He Xiaolu Qu Yueting Tang Bangmin Song Jieping Huang Guoqiang Yi
Dans la famille des Suidés, les phacochères présentent une adaptabilité de survie et une spécificité de trait significatives. Cette étude propose une analyse génomique comparative entre le phacochère et d’autres espèces de suidés, notamment le porc Luchuan, le porc Duroc et le potamochère de la rivière Rouge. En intégrant les quatre génomes avec des séquences des quatre autres espèces, nous avons identifié 8 868 gènes orthologues à copie unique. Sur la base de 8 868 séquences protéiques orthologues, les évaluations phylogénétiques ont mis en évidence des chronologies de divergence et des branches évolutives uniques au sein des espèces suidés. Les phacochères existent sur différentes branches évolutives par rapport aux DRC et aux LC, avec un temps de divergence précédant celui des DRC et des LC. Des analyses de contraction et d’expansion de familles de gènes de phacochère ont été menées pour élucider les mécanismes de leurs adaptations évolutives. En utilisant les bases de données GO, KEGG et MGI, les phacochères ont montré une préférence pour l’expansion des gènes sensoriels et la contraction des gènes métaboliques, soulignant la diversité phénotypique et la direction de l’évolution adaptative. L’association de gènes à la base de données QTLdb-pigSS11 a révélé des liens entre les familles de gènes et les traits d’immunité. Le chevauchement des gènes olfactifs dans les régions QTL liées au système immunitaire a mis en évidence leur importance dans les adaptations évolutives. Ce travail met en évidence les stratégies évolutives uniques et les mécanismes d’adaptation des phacochères, orientant les recherches futures sur l’adaptabilité distincte et la résistance aux maladies chez les porcs, en se concentrant particulièrement sur des traits tels que la résistance au virus de la peste porcine africaine.
Bibliographie :
Dictionnaire analytique d’économie politique/C.,Informations sur cet ouvrage.
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